Rumah Sakit Hidayatullah merupakan inisiasi dari kepedulian yang dilakukan oleh Islamic Medical Service yang merupakan lembaga nirbala milik masyarakat Indonesia yang berkhidmat pada program kesehatan dan kemanusiaan dengan dana ZISWAF (Zakat, Infaq, Shadaqah, Wakaf).

Pembangunan dan pengadaan fasilitas Rumah Sakit bertujuan untuk memberikan memberikan pemenuhan kebutuhan dasar dalam bidang kesehatan/medis. Dari hasil pengelolaan sektor ini akan disalurkan pada program pendidikan, dakwah dan kemanusiaan.